Het verhaal van de Crysis reeks
Alles wat je tot nu toe moet weten!
Zich een weg banend door de dicht beboste jungle ontvangen ze een noodsignaal van Aztec die smeekt om hulp omdat hij aangevallen wordt door een ongekend wezen. Wanneer Nomad en Psycho op Aztec's laatst bekende locatie aankomen, vinden ze het levenloze en zwaar verminkte lichaam van hun strijdmakker. De twee besluiten de zelfvernietigingfunctie van hun gevallen kameraads Nanosuit te activeren en verder te zoeken naar de twee overige leden van Raptor Team. De vier ontmoeten elkaar opnieuw midden in de jungle, waar ze tot een vreemde ontdekking komen. Midden in het oerwoud bevindt zich een vrachtschip, dat vreemd genoeg volledig bevroren is ondanks de tropische temperaturen die heersen op het eiland.
Na een korte verkenning van de omgeving vindt Psycho een kaart waarop de locatie van de archeologische site is op aangeduid. Plots klinkt er een vreemde mechanische gil, waarop vervolgens de boei van het schip open gescheurd wordt door een vreemd wezen dat Jester vastgrijpt en met hem wegvliegt. De drie overgebleven teamleden zetten snel de achtervolging in, enkel om het levenloze lichaam van Jester terug te vinden. Ook bij hem wordt de zelfvernietigingfunctie van zijn pak geactiveerd, zodat Noord-Koreaanse troepen de Amerikaanse technologie niet in handen zouden krijgen.
Met het verlies van hun strijdmakkers in het achterhoofd stoten de drie overige Raptor leden plots op één van de onderzoekers die ze moesten bevrijden. Na wat info uit heb geperst te hebben blijkt dat deze een undercover CIA-agent is die als opdracht had het onderzoek van Dr. Rosenthal op te volgen. Het team, dat zich meer en meer vragen beginnen te stellen bij de 'eenvoud' van hun missie, proberen JSOC te contacteren. Maar ze komen tot de akelige vaststelling dat alle communicatie met hun opdrachtgever verstoord wordt. De drie besluiten om verder te trekken wanneer Nomad plots nog een onderzoeker dood aantreft. Ook stelt hij vast dat verschillende KPA-soldaten op dezelfde manier werden gedood . De gesneuvelde soldaten werden namelijk allemaal doorboord door ijsscherven.
Op de rand van een klip aangekomen weerklinkt opnieuw de vreemde mechanische schreeuw als bij het bevroren slagschip. Opnieuw duikt het wezen dat eerder Jester meesleurde op en deze keer het heeft zijn zinnen deze keer gezet op de teamleider Prophet. Nomad en Psycho blijven alleen achter wanneer ze plots gecontacteerd worden door het Amerikaanse leger. Deze stellen voor om de missie af te breken, wegens het hoge sterfgehalte van teamleden. Nomad weigert deze nederlaag toe te geven en besluit de missie verder te zetten.
Wel besluiten Nomad en Psycho om te hergroeperen met het Amerikaanse leger. Deze vraagt hen om een legereenheid te assisteren die de opdracht gekregen heeft om een belangrijke weg te verdedigen. Wanneer de twee supersoldaten echter op het slachtveld aankomen, worden ze onmiddellijk in het heetst van de strijd geworpen. De Amerikaanse eenheid wordt namelijk zwaar onder vuur genomen door de KPA vanuit een nabijgelegen haven. Na het uitschakelen van het anti-luchtvaartgeschut baant Nomad zich een weg naar het archeologisch centrum.
Daar treft hij Dr. Rosenthal aan, die volop in de weer is met het onderzoeken van een gefossiliseerde machine. Nomad activeert de Stealthmode van zijn Nanosuit en overhoort een gesprek tussen Rosenthal en generaal Kyong, een Koreaanse opperbevelhebber die aanwezig is op het eiland. Rosenthal vertelt hoe dit fossiel het eerste intacte exemplaar is die ooit gevonden werd en hoe opgravingen in Afghanistan en Siberië enkel gedeeltelijke fossielen opleverden. Ook stelt de archeoloog vast dat dit fossiel twee miljoen jaar ouder is dan de mensheid zelf. Het onderzoek wordt abrupt onderbroken wanneer Rosenthal tot de vaststelling komt dat hij niet te maken heeft met een fossiel, maar met een nog levensvatbaar exemplaar.
Door elektriciteit te onttrekken van nabijgelegen elektronische apparatuur komt stilaan weer leven in de blootgelegde machine. Rosenthal waarschuwt Kyong en zijn dochter Helena voor het grote dreiging die de buitenaardse machines kunnen betekenen, maar door elektromagnetische stromingen valt de communicatie uit. Ook Nomad ondervindt problemen met zijn Nanosuit, die automatisch zijn Stealthmode uitschakelt. Hierdoor wordt hij ontdekt door Rosenthal, die hem zegt dat Kyong van plan is een grote site in een berg bloot te leggen. Nomad krijgt de opdracht om dit te voorkomen.
Nadat hij zichzelf een weg in de mijn gevochten heeft, lokaliseert Nomad Generaal Kyong en Helena. Zij waarschuwt voor de desastreuze gevolgen die het afsteken van explosieven kan hebben op de archeologische vondsten. Kyong negeert haar raad en zet zijn plannen verder. Net wanneer Nomad op het punt staat om in te grijpen, wordt hij overmeesterd door enkele elitesoldaten van de KPA, die ook in het bezit zijn van een Nanosuit. Nomad wordt voor Kyong gebracht, die niet echt opgetogen is met de inmenging van Amerikaanse Special Forces in zijn plannen. Hij deactiveert Nomad's Nanosuit, waarop onze held moet toekijken hoe Kyong zijn "tempel", die hij eerder aanziet als 's werelds grootste energiebron, opgraaft door middel van een explosie. Maar wanneer het personeel van Kyong hem waarschuwt voor mogelijke complicaties, slaan bij de Generaal de stoppen door.
Hij zal geen tegenspraak dulden nu hij zo dicht bij het einddoel van zijn plan is en executeert als voorbeeld één van de computeringenieurs. Plots herleeft de zogenaamde tempel met een storm van elektrische ontlading. Dit heeft niet enkel tot gevolg van Kyong en zijn mannen even gedesoriënteerd zijn, maar ook de Nanosuit van Nomad heeft zijn tweede adem gevonden. Hij raakt slaags met Kyong, en weet hem uit te schakelen. Kyong wordt voor dood achter gelaten en Nomad en Helena moeten de site, die op instorten staat, ontvluchten. Halverwege de mijnschacht blijft hun lift echter hangen, waarop een VTOL de mijn moet indalen om Helena te redden. Nomad blijft alleen achter wanneer de lift naar beneden stort.